09. 08. 1998 tarih ve 23428 sayılı Resmi Gazete’de yayınlanan yönetmelikle faaliyetine başlayan  Balıkesir Yöresi Kültürünü Araştırma ve Uygulama Merkezinin kurucu müdürü Prof. Dr. Ali DUYMAZ’dır.  2005-2007 yılları arasında Doç. Dr. Mehmet AÇA, 2007-2015 yılları arasında Yrd. Doç. Dr. Abdülkerim GÜLHAN müdürlük görevini üstlenmiştir.